Przyczyna zwykle tkwi w niewłaściwym odzywianiu żółwia, szczególnie "biegunkogenne" są owoce. Inne przyczyny biegunki to np. stres, infekcja (np. wywołana spożyciem brudnej wody, brudnego pożywienia), spożycie pokarmu zbyt zimnego, wreszcie zarobaczenie. Niekiedy może ją wywołać również niedobór witaminy A.
W każdym przypadku choroby należy w pierwszej kolejności naprawić błędy hodowlane i poprawić warunki bytowe żółwia. Na razie obserwuj żółwia, podawaj szczególnie rośliny bogate w błonnik (dobrze robi na persystaltykę jelit), listki przed podaniem zawsze dokładnie umyj i osuszaj. Wskazane jest też podawanie lucerny.
Niezaleznie od tego dobrze byłoby oddać do badania kał żółwia.
Biegunka sprzyja odwodnieniu więc dbaj o to, by żółw miał stały dostęp do baseniku ze świeżą wodą.